《猫和老鼠在纽约第二季》延续了第一季的叙事风格，展示汤姆和杰利这对经典冤家在现代都市的爆笑冒险，整体剧情紧凑且充满欢乐。汤姆与杰利来到了繁华的纽约市，继续他们之间恶作剧与追逐戏码的同时，也融入了更多现代元素和新颖情节。两人在曼哈顿的大街小巷、中央公园以及各种著名地标展开追逐，如时代广场和百老汇等。汤姆常常企图捕捉杰利，但杰利凭借其机智和灵活总是能巧妙逃脱。期间，他们还遇到了许多新角色，例如汤姆试图赢得另一只猫咪的芳心，而杰利则努力保护自己的朋友免受汤姆的骚扰。这一季增加了故事的趣味性和复杂性，也使角色之间

汤姆在追逐杰利时不小心被木棒击昏，醒来后却表现得像只老鼠，他不仅爱吃奶酪，还对杰利大表好感，甚至赖在杰利的家里。苦恼的杰利开始积极查找医书，竟找到一个医治汤姆的妙方。

家猫和野猫开始争食小老鼠，有恩必报的杰利救了大狗，从此杰利身边有了保护神，爆竹风波、场面火爆，汤姆和杰利玩起爆竹大战，可怜的汤姆伤势不轻，汤姆和杰利共享百万遗产，让汤姆痛苦难耐。